Σε μια πολύ δύσκολη περίοδο για την  Ελλάδα, κατά τη διάρκεια  του  εμφύλιου πόλεμου και ενώ η Θεσσαλονίκη είχε περιορισμένο αριθμό ποδοσφαιρικών συλλόγων έκανε την εμφάνισή του η ομάδα του Εθνικού Πυλαίας. Η  Πυλαία έως εκείνη τη χρονική περίοδο δεν είχε οργανωμένα σωματεία. Υπήρχαν οι λεγόμενες ομάδες της γειτονιάς που διοργάνωναν τοπικά  πρωταθλήματα εντός του Οικισμού.

Ένα μεσημέρι στο καφενείο του Σπυρούδη εν έτη 1950 ιδρύθηκε ο Εθνικός Πυλαίας. Μεταξύ των ιδρυτικών μελών ήταν οι  ο Καραμπουρνιώτης Αντώνιος (Μπαρμπαντώνης),ο Γιαννακούδης Κωνσταντίνος, ο Μπαροτούδης Στέλιος, ο Ματζαρλής Ηλίας, ο Γκούλιος Βάιος, ο Χατζηγεωργίου Βασίλειος κ.ά. Ο Τσούκας Δημήτριος φιλοτέχνησε το σήμα της ομάδας.

Ο Εθνικός Πυλαίας έλαβε μέρος στο πρωτάθλημα της Ε.Π.Σ.Μ. για πρώτη φορά το 1952 και σε λιγότερο από  10 χρόνια ανέβηκε στην πρώτη κατηγορία, στην οποία αγωνίστηκε έως το 1962 .  Το 1977 επανήλθε στην υψηλότερη κατηγορία όπου και παρέμεινε έως το 2005. Κατέκτησε το Κύπελλο της Ε.Π.Σ. Μακεδονίας την αγωνιστική περίοδο 1976-1977 όταν κέρδισε στον τελικό την ομάδα του Ελευθεριακού.

Η πιο αξιοζήλευτη διάκριση έλαβε μέρος την αγωνιστική περίοδο 1965-1966 όταν για το Κύπελλο της Ελλάδας έφτασε στα προημιτελικά μετά από αποκλεισμό του Ιστορικού Μέγαλου Αλεξάνδρου, του Ηρακλή Θεσσαλονίκης , του ΠΑΟΚ και της Παναχαϊκής. Δυστυχώς η πορεία του Εθνικού ανακόπηκε μέσα στα Τρίκαλα όπου και δέχθηκε 7 τέρματα.

Οι πιο γνωστοί ποδοσφαιριστές που έχουν αναδειχθεί από τα σπλάχνα του Εθνικού Πυλαίας είναι οι Φάνης Κατεργιαννάκης & Γιώργος Ανατολάκης.

ΤΙΤΛΟΙ
Α ΕΠΣΜ: 1993, 1995
Β ΕΠΣΜ: 1977
Γ ΕΠΣΜ: 1959
Κύπελλο ΕΠΣΜ: 1977

Πηγή: Staxera.Wordpress.com